هناك العديد من مصادر hMSCs المستخدمة في الإعداد السريري. وهي مقسمة إلى نوعين من المصادر: الخلايا الجذعية السرطانية البالغة، والتي تشمل نخاع العظم، والأنسجة الدهنية، والدم المحيطي، ولب الأسنان، والخلايا الجذعية السرطانية المشتقة من الأنسجة الوليدية، والتي تم الحصول عليها من المشيمة والسلى والحبل السري.

تعد الخلايا الجذعية الصلبة في نخاع العظم هي الأكثر استخدامًا على نطاق واسع في التجارب السريرية (CT)، ولكن الخلايا الجذعية الصلبة من الأنسجة المرتبطة بالولادة قد يكون لها خصائص بيولوجية ملحوظة، مثل القدرة التكاثرية العالية، وعمر الحياة، وإمكانية التمايز، بشكل مستقل عن مصدر العزلة، تتم دراسة الخلايا الجذعية السرطانية بشكل مكثف على الأشعة المقطعية فيما يتعلق بقدرتها على التجدد، وفي نشاطها

المناعي، خاصة في الاستجابة لتفاعلات المضيف مقابل الكسب غير المشروع. ومع ذلك، اعتمادًا على المصدر، فإن هذه الخلايا لديها اختلافات في النمط المناعي والتي تفسر بعض الاختلافات في استجاباتها. أوجه التشابه التي تظهرها الخلايا الجذعية الصلبة البالغة هي التعبير الإيجابي عن CD44 وCD90 وCD105 (SH2) وCD166، والتعبير السلبي عن CD14 وCD34 ، إن ما يميز الخلايا الجذعية الصلبة لب الأسنان هو غلبة التمايز في المختبر إلى خلايا عصبية.

تحتوي الخلايا الجذعية السرطانية المشتقة المرتبطة بالولادة على ملف تعريف علامة تعبير سطحي أكثر بدائية. لا تمتلك الخلايا الجذعية السرطانية وخلايا الخلايا الجذعية السرطانية في الحبل السري القدرة في المختبر على تحقيق التمايز الدهني، كما أن الخلايا الجذعية السرطانية المشتقة من المشيمة وخلايا الخلايا الجذعية الصلبة الموجودة في الحبل السري تعبر عن جينات عوامل النمو المكونة للدم التي تمنحها القدرة على دعم توسع الخلايا الجذعية المكونة للدم.