إن علم أمراض السارس- CoV-2 لم يتم فهمه بالكامل بعد؛ استندت معظم معرفتنا إلى الأبحاث التي أجريت على فيروس السارس وفيروس كورونا المسبب لمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية، اللذين تسببا في السابق في أوبئة المتلازمات التنفسية الحادة. في هذه المدة القصيرة للوباء الحالي، أظهرت الدراسات أن فيروس SARS-CoV-2 لديه العديد من آليات الدفاع، مما يجعل القضاء عليه أكثر صعوبة. يتضمن غلاف SARS-CoV-2 بروتينات متصلة مثل M (الغشاء)، وS (السنبلة)، وE (المغلف)، وN (القفيصة النووية).

على غرار الفيروسات التاجية الأخرى، يمنع البروتين N الموجود في SARS-CoV-2 IFN1 عن طريق تنظيم تخليق IFN-β والإشارة إليه. من ناحية أخرى، تعتمد فعالية الاستجابة المناعية الفطرية ضد العدوى الفيروسية بشكل أساسي على إنتاج IFN1 وإشاراته النهائية التي تؤدي إلى التحكم في تكاثر الفيروس وتحفيز الاستجابة المناعية التكيفية الكافية. ومع ذلك، يمكن للفيروس تجنب هذا الهجوم بسبب خلل التنظيم المناعي المعقد الناجم عن هذه العدوى, التحفيز المزمن للخلايا التائية، مما يؤدي إلى عاصفة

السيتوكين واستنفاد الخلايا التائية، يضعف دفاعات الجسم الشاملة ويضع المريض في موقف خطير. تؤدي الالتهابات الفيروسية المزمنة عالية الجودة إلى استنفاد الخلايا التائية CD8+ (تكس) مما يؤدي إلى انخفاض وظيفة المستجيب وانخفاض القدرة التكاثرية.

يؤدي تكس إلى الإفراط في التعبير عن المستقبلات المثبطة، بما في ذلك CD279 (PD-1)، وهو بروتين سطح الخلية اللمفاوية من فصيلة Ig الفائقة، وعضو في عائلة CD28/CTLA-4 الممتدة من منظمات الخلايا التائية، والتي تعمل كخلايا ناضجة. نقطة تفتيش الخلايا التائية لتعديل موت الخلايا المبرمج. يمكن أن يرتبط PD-1 بأي من روابطه (PD-L1[CD274] وPD-L2[CD273]) وكلاهما عضو في عائلة B7 من المستقبلات المشتركة للخلايا التائية. يؤدي هذا الارتباط إلى تثبيط كبير لجهاز المناعة من خلال التأثير على الخلايا التائية، وكذلك الخلايا البائية والخلايا القاتلة الطبيعية.

ملاحظة مهمة أخرى هي العلاقة القوية بين علامات الالتهابات، بما في ذلك ESR وCRP وIL-6 والمجموعة الفرعية ذات الصلة من الخلايا الليمفاوية بشكل عام، تظهر قلة اللمفاويات العامة لدى مرضى كوفيد-19، خاصة في الحالات الشديدة.