أدى اكتشاف الخلايا الجذعية المقيمة في القلب إلى جيل ثان من الدراسات التي تتضمن عزلها وتضخيمها واستخدامها افي علاج عضلة القلب المصابة. من بين مجموعات الخلايا الجذعية القلبية التي تم تحديدها في أنواع مختلفة من الثدييات: Islet-1 + (Isl-1 +)  ، c-kit + ،Sca-1 + و Sca-1 + PDGFR + CSCs ،

المجموعات الجانبية (SP) للخلايا الجذعية القلبية التي يمكنها تدفق الصبغة ، Hoechst 33342 ؛ الخلايا المشتقة من epicardium (EPDCs) ؛ و CDCكل من هؤلاء قد عرض خصائص التجديد الذاتي، الاستنساخ وإمكانية التمايز. بينما أظهرت ckit + و Isl-1 + و Sca-1 + و SP CSCs إمكانية التحول إلى الخلايا العضلية للقلب والخلايا البطانية وخلايا العضلات الملساء الوعائية وفي بعض الحالات أنسجة التوصيل القلبي

كانت الأنواع الفرعية الأخرى Sca-1 + PDGFR + و EPDCs و CDCs مشابهة للخلايا MSCs المقيمة في القلب. حتى الآن، تم إنجاز أكبر قدر من العمل لمجموعة c-kit + CSCs و CDCs والتي تم تطويرها من نماذج ما قبل السريرية من MI وHF ، لدراستها في المرضى البشر الذين يعانون من نقص تروية HF ،لقد ثبت أن الخلايا الجذعية القلبية لها وظائف متناقصة في المرضى الذين يعانون من اعتلال عضلة القلب بعد احتشاء عضلة القلب في المرحلة النهائية.

أدى زرعهم في نماذج حيوانية صغيرة وكبيرة من احتشاء عضلة القلب المزمن إلى زيادة وظائف عضلة القلب وتخفيف إعادة التشكيل الضارة وتقليل الندبات. ومع ذلك، فقد أثارت بعض البيانات تساؤلات حول قدرتها الفعلية على تكوين عضلة القلب، ومدى مساهمتها بشكل مباشر في استبدال خلايا عضلة القلب