على الرغم من أن كوفيد-19 له مظاهر عديدة، إلا أن إصابة الرئة وفشل الجهاز التنفسي الحاد (SRF) أكثر شيوعًا من غيرها.

حجر الزاوية في هذه الحالة هو MAS/sHLH أو خلل التنظيم المناعي. تفرز البلاعم السنخية IL-6 الذي يسبب الإفراط في إنتاج السيتوكينات المؤيدة للالتهابات بواسطة الخلايا الوحيدة، وخلل تنظيم الخلايا الليمفاوية، الذي يتميز بنقص اللمفاويات CD4 وبالتالي قلة اللمفاويات في الخلايا البائية. في موازاة ذلك، يتم استنفاد عدد الخلايا القاتلة الطبيعية المطلقة (NK)، ربما نتيجة للفيروس الذي يتكاثر بسرعة. علاوة على ذلك، يقلل IL-6 من تعبير HLA-DR على الغشاء وإنتاج IFN-γ بواسطة خلايا CD4.

في الختام، يبدو أن المناعة الفطرية، التي تتميز بالعدلات والسيتوكينات المسببة للالتهابات على شكل عاصفة السيتوكين، تحاول الحد من العدوى والتغلب على الفيروس؛ ومع ذلك، فإنه يؤدي إلى استجابة التهابية مفرطة بدلاً من الإضرار بالفيروس. يؤدي هذا إلى إصابة الرئة مع تلف الأنسجة والوذمة التي تهدد الحياة، المخصب بالميوسين والفيبرين، والذي يسبب للأسف SRF والوفاة في المرضى المصابين بشدة.